Preview

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

Расширенный поиск
№ 1 (2018)
Скачать выпуск PDF
https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-1

ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ 

3-9 212
Аннотация
Цель. Определение функциональных групп бифидофлоры толстого кишечника человека на основе анализа особенностей спектра метаболитов, протеома, биопрофиля, иммунорегуляторных свойств и способности проводить дифференцировку «свой-чужой» среди ассоциантов. Материалы и методы. Материалом служили 260 штаммов бифидобактерий, выделенных из 122 кишечных микросимбиоценозов. Экспериментальные исследования проводились с использованием бактериологических, хроматографического и иммунологических методов. Статистическая обработка материала выполнена средствами пакета Statistica 10.0 с использованием k-кластерного анализа и дискриминантного метода. Результаты. В результате работы определены 3 кластера, содержащих штаммы различных видов бифидобактерий. Первый кластер был представлен В. bifidum и характеризовался наличием антипептидной активности штаммов в отношении FNO-a и INF-y, IL-10. Во втором кластере преобладали культуры В. longum, где значимыми были параметры системообразующего фактора микросимбиоценоза, способность к микробному распознаванию, антагонистическая активность и продукция уксусной кислоты. В третьем кластере видовой состав бифидобактерий был разнообразен, а информативными тестами явились - продукция штаммами масляной, капроновой кислот и их изоформ. Заключение. Ключевая функция бифидофлоры в регуляции гомеостаза кишечного биотопа реализуется за счет образования функциональных кластеров, среди которых первая группа участвует в формировании цитокинового баланса, вторая - ответственна за дискриминацию ассоциативной микробиоты и прямую защиту биотопа от патогенов, а третья необходима для поддержания барьерной метаболической функции энтероцитов в толстом кишечнике человека.
10-16 217
Аннотация
Цель. Изучить основные эпидемиологические проявления стрептококковой (группы А) инфекции в России и оценить масштаб проблемы. Материалы и методы. Проведен ретроспективный эпидемиологический анализ данных официальной статистической отчетности (ф.2, ф.12) о заболеваемости и распространенности наиболее значимых форм СГА-инфекции за 2009 - 2016 гг. Результаты. Отмечено незначительное снижение показателей общей (суммарной) заболеваемости СГА-инфекцией в РФ. В среднем каждый год заболевали 1,8 млн человек, среди которых 600 тыс. - дети 0-14 лет. Анализ заболеваемости острой ревматической лихорадкой (ОРЛ) за 2009 - 2016 гг. показал отсутствие достоверной тенденции к снижению заболеваемости (2,0 на 100 тыс). Группа риска - подростки, основной удельный вес составляют взрослые (64%). Заболеваемость хроническими ревматическими болезнями сердца (ХРБС) в последние годы имеет достоверную тенденцию к росту показателей (t=3,8; р<0,05). Этой формой СГА-инфекции в среднем заболевают в 5 раз чаще, чем ОРЛ. Распространенность как ОРЛ, так и ХРБС продолжает достоверно снижаться. Ежегодно от ОРЛ и ХРБС умирают 2,5 тыс. человек. Заболеваемость скарлатиной в последние годы среди детского населения России достоверно уменьшилась с 240,7 до 129,7 на 100 тыс. населения (t=91,4; р<0,05). Распространенность хронических болезней миндалин и аденоидов (ХБМА) достоверно растет, что обусловлено в основном ростом этих показателей в группе взрослого населения. По сравнению с предшествующим периодом (1996 - 2007 гг.) улучшилась ситуация с заболеваемостью болезнями кожи и подкожной клетчатки (БКПК) и распространенностью болезней почек (БП). Заключение. Полученные данные свидетельствуют о высокой распространенности стрептококковой инфекции в стране.
17-23 138
Аннотация
Цель. Изучение прогностической эпидемиологической и экономической эффективности вакцинопрофилактики пневмококковой инфекции у мужчин с различными хроническими заболеваниями. Материалы и методы. На основе данных литературы построена прогностическая модель (Марковская модель) и проведена оценка предполагаемой эффективности вакцинации в 5-летней перспективе у мужчин трудоспособного возраста против пневмококковой инфекции в снижении смертности, предотвращенной заболеваемости и экономического ущерба. По данным официальной статистической отчетности, группа высокого риска заболевания пневмонией в РФ включает 21 575 887 мужчин трудоспособного возраста. Источниками данных о стоимости заболевания служили государственные тарифы в системе ОМС за 2016 год, а о стоимости вакцинопрофилактики - результаты конкурсных торгов по закупкам конъюгированной пневмококковой 13-валентной вакцины (ПКВ13). Результаты. Экстраполяция данных отечественных и зарубежных исследований на когорту лиц с хроническими заболеваниями органов дыхания, болезнями системы кровообращения или сахарным диабетом показала значимое снижение риска развития осложнений основного заболевания (ОР=0,58, р<0,05), числа госпитализаций (ОР=0,02, р<0,05) и ожидаемой смертности на фоне вакцинации. Затраты на вакцинацию оцениваемой группы пациентов составили 25 869,5 млн руб. Применение ПКВ13 позволит статистически значимо сократить число обострений и соответственно госпитализаций, что позволит экономить в каждый последующий год после вакцинации около 14 359,9 млн руб. Таким образом, уже в 2-летнем горизонте суммарная экономия бюджетных средств составит 2 850,30 млн руб. В 5-летней перспективе будет сохранено как минимум 61 702 жизней пациентов при условии однократной вакцинации ПКВ13. Заключение. Результаты данного исследования свидетельствуют о высокой эпидемиологической и клинической эффективности вакцинации против пневмококковой инфекции мужчин трудоспособного возраста, страдающих хроническими заболеваниями. Она снижает заболеваемость, число обострений и госпитализаций, а также смертность в группе вакцинированных и является экономически выгодной инвестицией в здравоохранение.
23-31 144
Аннотация
Цель. Выявить потенциальных возбудителей заболеваний, способствующих развитию инфекционного процесса при осложнениях в послеоперационный период у детей с врожденными пороками развития сердца и почек, для разработки эффективной профилактики катетер-ассоциированной мочевой инфекции. Материалы и методы. Клиническим материалом для исследования служили образцы испражнений, мочи и мочевых катетеров Фолея (Unomedica) от шестнадцати детей с врожденными пороками сердца, находившихся на лечении в НМИЦим. В.А.Алмазова. Таксономическую принадлежность выделенных чистых культур определяли, используя идентификационные системы RapID Systems (США). Чувствительность выделенных из клинического материала бактерий кантимикробным препаратам анализировали методом дисков (НИЦФ, Россия). Электронномикроскопический анализ микробных популяций на катетерах проводили, используя сканирующую электронную микроскопию. Полученные культуры Escherichia coli тестировали на наличие генов а-гемолизинов Ыу А, В, С с помощью ПЦР в реальном времени на детектирующем амплификаторе DTlite (ДНК-Технология, Россия). Результаты. В моче у 3 из 16 пациентов выделены Staphylococcus aureus и Е. coli. При посеве испражнений у 56% пациентов обнаружены грамположительные кокки, а у 44% - грамотрицательные палочки. У 10 из 16 пациентов выделены культуры микроорганизмов с внутренней поверхности стенок катетеров; преобладали смешанные культуры, среди которых превалировали S. aureus и Е. coli. 85% штаммов S. aureus, выделенных со стенок мочевых катетеров, проявляли устойчивость к метициллину. У 60% культур Е. coli определены гены а-гемолизинов (Ыу А,В,С), способствующих формированию бактериальных биопленок. При электронно-микроскопическом исследовании в двух образцах мочевых катетеров обнаружены актиномицетоподобные формы бактерий, невыявляемые при первичном бактериологическом исследовании. Заключение. Ранняя диагностика катетер-ассоциированных мочевых инфекций у детей с врожденными пороками развития сердца требует разработки комплексного подхода, включающего наряду с классическим микробиологическим анализом обязательное использование других современных методов диагностики.
32-39 191
Аннотация
Цель. Сравнение популяционного иммунитета населения РФ к вирусам гриппа накануне эпидемических сезонов 2015 - 2016 и 2016 - 2017 и исследование образцов от пациентов с тяжелым течением заболевания. Материалы и методы. Тестирование сывороток в реакции торможения гемагглютинации с референс-антигенами. Выделение изолятов из клинического и аутопсийного материала и их характеристика. Результаты. По сравнению с 2015 г. к осени 2016 г. уровень популяционного иммунитета к вирусам гриппа A(HlNlpdm09) и A(H3N2) возрос. Эпидемический сезон 2015 - 2016, преобладающими в котором были вирусы A(HlN)lpdm09, относившиеся по гемагглютинину к новой генетической группе 6В. 1, характеризовался повышенным количеством случаев тяжелого течения, летальных исходов. Один процент исследованных изолятов имел в нейраминидазе аминокислотную замену H275Y и был резистентен к осельтамивиру. В сезоне 2016 - 2017 случаев тяжелого течения было меньше, преобладали вирусы А(Н 3N2) и B/Victoria. По гемагглютинину изоляты A(H3N2) входили в кладу ЗС.2а, а штаммы B/Victoria - в группу 1А. Все тестированные изоляты были чувствительны к антинейраминидазным препаратам. Заключение. Рассмотренные сезоны отличались по интенсивности эпидемического процесса, доминирующему подтипу вируса гриппа А. Иммунизация вакциной с обновленным Н1N1pdm09-компонентом необходима для формирования популяционного иммунитета к новым штаммам данного подтипа группы 6В.1. Антинейраминидазные препараты рекомендуются в терапии гриппа.
39-45 207
Аннотация
Цель. Изучение особенностей вспышки внебольничной пневмонии, обусловленной M.pneumoniae, у детей в Хабаровском крае в осенне-зимний период 2016 - 2017 гг. Материалы и методы. Проведено исследование 30 клинических образцов - мазков с задней стенки глотки и образцов мокроты, полученных у пациентов с внебольничной пневмонией, обусловленной М. pneumoniae. Образцы были исследованы на наличие мутаций в гене 23S рРнк М. pneumoniae. Результаты. Возраст пациентов составил от 2 до 16 лет. В двух случаях имели место семейные очаги заболеваемости внебольничной пневмонией. В 19 образцах была выявлена мутация в 23S рРНК Mycoplasma pneumoniae. Заключение. Полученные данные свидетельствуют о том, что в развитии вспышки внебольничной пневмонии, обусловленной M.pneumoniae, у детей в Хабаровском крае в осенне-зимний период 2016 - 2017 гг. участвовали макролидрезистентные штаммы возбудителя.
45-52 193
Аннотация
Научно обоснована номенклатура приоритетных патогенных биологических агентов (ПБА) и вызываемых ими инфекционных болезней для лабораторной диагностики при обеспечении биологической безопасности массовых мероприятий. Оценку ПБА (вирусов, бактерий, биологических токсинов I - IV групп патогенности) проводили, используя критерии, позволяющие на качественном уровне прогнозировать их потенциальное негативное воздействие. Разработана научно обоснованная номенклатура ПБА, представляющих наибольшую угрозу биологической безопасности вне зависимости от их приуроченности к территории риска и времени риска. В перечень вошли возбудители бактериальных (чума, сибирская язва, холера) и вирусных (ортопоксвирусы, филовирусы, аренавирусы, коронавирусы, ортомиксовирусы) инфекций, относящиеся к I - II группам патогенности. Подготовлена номенклатура возбудителей широко распространенных природно-очаговых (туляремия, лептоспироз, Ку-лихорадка, геморрагическая лихорадка с почечным синдромом, орнитоз) и убиквитарных (бруцеллез, геморрагический колибак-териоз, гемолитико-уремический синдром, кишечный иерсиниоз, псевдотуберкулез, болезнь легионеров) инфекций, способных вызвать серьезное осложнение санитарно-эпидемиологической обстановки. На основании проведенной оценки опасных биологических факторов был сформирован универсальный перечень ПБА для приоритетного обеспечения готовности к лабораторной диагностике в период массовых мероприятий.
52-57 117
Аннотация
Цель. Идентификация иммуногенных белков штаммов Bacillus anthracis, продуцируемых в условиях, имитирующих организм хозяина. Материалы и методы. В работе использованы культуральные фильтраты изогенных вариантов штамма B.anthracis 575/122: R02 (рХОГ рХО2+); R01 (рХО1+ рХО2‘); R00 (рХОГ рХО2), полученные в условиях, имитирующих организм хозяина. В одномерном электрофорезе и иммуноблоттинге с гипериммунными сыворотками определены иммунодоминантные белки, которые идентифицированы в MALDI TOF MS. Результаты. В иммуноблотинге выявлены белки м.м. 97 - 14,1 кДа. Белок 90 кДа штамма B.anthracis 575/122 R01 в MALDI TOF MS идентифицирован как протективный антиген м.м. 85,810 кДа, белок м.м. 60 - как GMP синтаза м.м. 57,239 кДа. В культуральных фильтратах трех штаммов определено два общих антигена: белок с м.м. 97 кДа, идентифицированный как ЕА 1 В. anthracis м.м. 91,361 кДа и белок м.м. 45 кДа - как энолаза В. anthracis м.м. 46,418 кДа. Заключение. Таким образом, условия, имитирующие организм хозяина, способствуют продукции иммунодоминантных белков В. anthracis. В MALDI TOF MS подтверждены данные по молекулярно-весовой характеристике протективного антигена и белка ЕА1, а также ряда протеаз В. anthracis. Результаты могут быть использованы при выделении этих белков с целью усовершенствования диагностических и вакцинных препаратов.
58-67 240
Аннотация
Цель. Целью данной работы было изучение бактерицидного действия сыворотки крови человека на Borrelia miyamotoi in vitro. Материалы и методы. Спирохеты В. miyamotoi, штаммы НТ31 и LB-2001, инкубировали в неиммунной сыворотке здоровых доноров (СЗД), в СЗД с инактивированной нагреванием системой комплемента, а также в образцах сыворотки крови переболевших ИКБ-БМ. Жизнеспособность (подвижность) боррелий после инкубации контролировали путем темнопольной микроскопии. Уровень сывороточных антител к специфическим белкам В. miyamotoi (ферменту GlpQ и поверхностным белкам Vlpl 5/16, Vlpl 8, Vsp 1, Vlp5) измеряли с помощью специально разработанного планарного белкового иммуночипа. Результаты. Боррелии полностью сохраняют жизнеспособность в неиммунной СЗД, но их подвижность частично или полностью подавляется при добавлении сыворотки крови переболевших ИКБ-БМ или кроличьих антител к В. miyamotoi. Иммобилизирующее действие иммунной сыворотки в существенной степени ингибируется при ее инактивации нагреванием, что указывает на опосредованность этого эффекта системой комплемента. Заключение. Антитело-зависимое комплемент-опосредованное бактерицидное действие сыворотки крови человека, вероятно, не является единственным, 100% эффективным механизмом защиты человека от инфекции В. miyamotoi, но требует поддержки со стороны клеточного иммунитета.
67-71 155
Аннотация
Цель. Изучение влияния экзополисахаридов (ЭПС) молочнокислых кокков на цитокиновую активность макрофагов мышей при фагоцитозе in vitro Staphylococcus aureus 209-P. Материалы и методы. В работе использовали ЭПС Streptococcus thermophilus и Lactococcus lactis В-1662. На 1, 3, 5 и 7 выделяли альвеолярные (АМФ) и перитонеальные (ПМФ) макрофаги и моделировали процесс фагоцитоза in vitro. Через 30 минут, 16 и 24 часа определяли содержание провоспалительных цитокинов ИЛ- 1а и ФНО-а. Результаты. ЭПС оказывали неоднозначное влияние на продукцию цитокинов. Наибольшее действие на синтез ИЛ-1 а и ФНО-а оказывал ЭПС S. thermophilus. Заключение. Результаты исследований позволяют говорить о возможности использования ЭПС S. thermophilus в качестве профилактического иммуностимулятора для коррекции цитокинового статуса животных.
72-76 335
Аннотация
Цель. Изучить молекулярно-генетические свойства штамма Shigella sonnei-2013, выделенного во время вспышки дизентерии в Республике Абхазия в 2013 г. Материалы и методы. Генетическое типирование исследуемого штамма осуществляли методом мультилокусного сиквенс-типирования (MLST). Анализировали нуклеотидные последовательности фрагментов 7 консервативных генов «домашнего хозяйства» adk, fumC, icd, mdh, purA, recA, gyrB. Секвенированные фрагменты ДНК сравнивали с референсными последовательностями из базы данных Escherichia coli MLST. Филогенетический анализ проводили с помощью метода UPGMA и компьютерной программы START 2. Полногеномное секвенирование выполняли на генетическом анализаторе Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM™) с использованием фрагментных библиотек (shot-gun). Картирование ридов проводили в программе GS Reference Mapper. Результаты. Определен сиквенс-тип исследуемого штамма - ST-152, являющийся одним из распространенных генотипов для S. sonnei. Показана высокая степень сходства полученных контигов с последовательностью хромосомы и плазмид А, В, С и Е штаммов S. sonnei 53G и S. sonnei Ss046. Выявлены контиги с высоким процентом сходства с последовательностью плазмиды вирулентности p026-Vir штамма Е. coli 026:Hli (Н30). В геноме штамма S. sonnei-2013 обнаружены, нуклеотидные последовательности 136 генов, расположенных на плазмиде p026-Vir штамма Е. coli 026:Н11 (Н30). Обнаружены гены, контролирующие биосинтез пилей IV типа, участвующих в адгезии к абиотическим поверхностям и формировании биопленки. Заключение. Выявлены структурные особенности штамма, обусловленные наличием фрагментов плазмиды вирулентности p026-Vir штамма Е. coli 026:Н 11 (НЗО).
76-84 190
Аннотация
Цель. Изучение частоты, характеристики инфекций нижних дыхательных путей и результатов микробиологических исследований биоматериала у ВИЧ-инфицированных пациентов. Материалы и методы. Использовались материалы Инфекционной клинической больницы № 1 г. Омск за 5 лет (2012 - 2016). Результаты. Из пролеченных 1926 ВИЧ-инфицированных инфекции нижних дыхательных путей встретились у 538 пациентов. На долю бактериальных пневмоний приходилось 45,2%, летальность при которых составила 18,1%. Был проведен анализ результатов микробиологических исследований биоматериалов у ВИЧ-инфицированных пациентов. Из мокроты наиболее часто выделялись Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecalis и другие микроорганизмы. Частой находкой в биоматериале были Streptococcus viridans и грибы рода Candida. Заключение. Полученные результаты требуют дальнейших исследований для сопоставления клинико-рентгенологических проявлений и результата микробиологического исследования биоматериалов ВИЧ-инфицированных больных.

ОБЗОРЫ 

84-92 228
Аннотация
В обзоре обобщены основные сведения о разработке и диагностических возможностях реакции латекс-агглютинации (РЛА), применяемой для целей обнаружения и последующей идентификации возбудителя мелиоидоза. Как свидетельствуют опубликованные данные, применение мелиоидозных моноклональных антител различной эпитопной направленности для изготовления суспензионного носителя - основного детектирующего ингредиента этой реакции, способствует повышению диагностических возможностей данного метода (его чувствительности и специфичности), что неоднократно было подтверждено специалистами, работавшими как в зонах эндемичного распространения Burkhold^ra pseudom^^i, так и вне этих территорий. Как отметило большинство авторов публикаций, после внедрения этой реакции в практическую работу профильных лабораторий, низкозатратная коммерческая продукция (тестовый набор реагентов для реакции латекс-агглютинации) может найти широкое применение как в стационарных, так и мобильных лабораториях. Несомненными достоинствами метода являются его простота, наглядность, пригодность для работы с различными образцами с объектов внешней среды и биологического материала, а также полученные доказательства возможности использования РЛА для обеспечения эффективной дифференциации В. pseudomallei от авирулентных родственных бактерий и выявления возбудителя на ранних стадиях заболевания за относительно короткие промежутки времени, что делает ее перспективным методом диагностики мелиоидоза, потенциально смертельной инфекции, требующей раннего начала соответствующей антибиотикотерапии.
93-101 293
Аннотация
Токсины - высокомолекулярные соединения, образуемые микроорганизмами, животными, растениями и обладающие антигеными свойствами. В последнее время в связи с возникшей угрозой террористических действий идентификация ряда бактериальных токсинов становится особенно актуальной. Новый подход в идентификации токсинов связан с развитием масс-спектрометрии и позволяет успешно проводить анализ большинства природных токсинов. Метод MALDI-MS позволяет проводить детекцию таких токсинов, как Shiga-toxin Escherichia coli, delta-toxin Staphylococcus aureus, цитотоксин Bacillus cereus, ботулинический нейротоксин, холерный токсин. Аналитические и диагностические характеристики метода, простота и скорость исследования свидетельствуют о перспективе внедрения метода в практику лабораторной диагностики при определении токсино-продукции исследуемых микроорганизмов.
101-111 220
Аннотация
Обзор содержит данные литературы, касающиеся основных вопросов образования биопленок возбудителями мелиоидоза и сапа (Burkholderia pseudomallei и Burkholderia mallei). Рассмотрена роль известных структурных элементов клеток буркхольдерий (жгутиков, пилей IV типа, ЛПС), а также белков-автотранспортеров адгезинов в прикреплении бактерий к поверхностям, формировании микроколоний и образовании биопленки. Представлены материалы исследования генетических регуляторных механизмов (QS-систем, RpoE-сигма фактора, c-di-GMP, двухкомпонентной системы трансдукции сигналов TCS) и данные о дифференциально экспрессирующихся генах, имеющих отношение к формированию биопленки В. pseudomallei. Приведены результаты изучения роли биопленок в вирулентности и резистентности к антибиотикам патогенных буркхольдерий и их значения в развитии хронических форм и рецидивирующего течения мелиоидоза и сапа.
112-119 197
Аннотация
В настоящее время проблема излишнего веса и ожирения, согласно данным ВОЗ, получает распространение не только в странах с большим уровнем дохода, но и во всех остальных. Такая ситуация вызывает беспокойство и заставляет ученый мир рассматривать ожирение со всех сторон, вовлекая в изучение этой проблемы специалистов всех областей. Микробном человека является его неотъемлемой частью. Однако его энергетической функции до недавнего времени придавалось небольшое значение. Его участие в обмене короткоцепочечных жирных кислот (КЖК) играет ключевую роль в энергетическом обмене энтероцитов, обеспечивая 70% энергии, в общем же метаболизме около 10% энергии синтезируется из КЖК. Короткоцепочечные жирные кислоты также влияют на активность аденозинмонофосфат-зависимой протеинкиназы, стимулируют выработку лептина, участвуют в синтезе холестерола. Микробном регулирует синтез глюкагон-подобного пептида, обладающего контринсулярным эффектом, правильный состав микробиома позволяет снизить уровень неспецифического воспаления; бифидо- и лактобациллы синтезируют изомеры линолевой кислоты, которые обладают противовоспалительным действием. В данной работе рассматривается целесообразность применения про-, пре- и эубиотических препаратов для лечения ожирения, а также состояний, которые могут осложнять его течение (атеросклероз, гипертония, депрессия).

УКАЗАТЕЛЬ СТАТЕЙ ЗА 2017 .ГОД 

СОДЕРЖАНИЕ 

ВНИМАНИЮ АВТОРОВ! 



Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0372-9311 (Print)
ISSN 2686-7613 (Online)