Preview

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

Расширенный поиск

Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

Полный текст:

Аннотация

ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора представляет приоритетные данные широкомасштабного популяционного ПЦР-исследования динамики уровня циркуляции SARS-CoV-2 среди условно здорового населения Москвы и Московской области.

Для цитирования:


Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Тиванова Е.В., Каленская А.В., Соловьева И.В., Вершинина М.А., Квасова О.А., Плоскирева А.А., Мамошина М.В., Елькина М.А., Андреева Е.Е., Иваненко А.В., Микаилова О.М. Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020;97(3):197-201. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

For citation:


Akimkin V.G., Kuzin S.N., Shipulina O.Yu., Yatsyshina S.B., Tivanova E.V., Kalenskaya A.V., Solovieva I.V., Vershinina M.A., Kvasova O.A., Ploskireva A.A., Mamoshina M.V., Elkina M.A., Andreeva E.E., Ivanenko A.V., Mikailova O.M. Epidemiological significance of detection of SARS-CoV-2 RNA among different groups of population of Moscow and Moscow Region during the COVID-19 outbreak. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2020;97(3):197-201. (In Russ.) https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

За период с 06.04.2020 по 24.05.2020 специа­листами ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотреб­надзора проведено популяционное исследование, которое позволило оценить уровень циркуляции SARS-CoV-2 среди населения Москвы и Москов­ской области. Всего обследовано 75 940 условно здоровых лиц, не имеющих симптомов респи­раторных заболеваний. Также с начала подъема заболеваемости COVID-19 в Московском регионе обследованы отдельные категории пациентов (n = 83 699). Исследования выполняли с помощью раз­работанной и производимой в ФБУН ЦНИИ эпиде­миологии Роспотребнадзора тест-системы «Ампли-Сенс® Cov-Bat-FL» (регистрационное удостовере­ние № РЗН 2014/1987 от 25.03.2020).

Из обследованной когорты условно здорового населения Московского региона РНК SARS-CoV-2 выявили у 5321 (7,01%) человека (95% ДИ1 6,83­7,19%), частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в Москве составила 7,12% (6,87-7,37%) и в Москов­ской области — 6,87% (6,60-7,14%), что позволяет констатировать отсутствие различий в частоте опре­деления РНК SARS-CoV-2 в этих субъектах России.

Важное значение для оценки эпидемиологичес­кой ситуации и определения направления ее эволю­ции имеет динамика анализируемого показателя (рисунок).

 

Уровень циркуляции SARS-CoV-2 среди условно здорового населения Москвы и Московской области в период развития эпидемии COVID-19.

The rate of SARS-CoV-2 circulation among relatively healthy residents of Moscow and Moscow Region during the COVID-19 epidemic outbreak.

 

Следует отметить, что значения показателя уровня циркуляции РНК SARS-CoV-2 были весьма вариабельными, причем в Московской области ко­лебания носили более выраженный характер, чем в Москве. Так, в Московской области обращают на себя внимание 5 пиковых значений: 11.04.2020 (15,2%), 28-29.04.2020 (15,4 и 17,9% соответствен­но), 03.05.2020 (13,5%) и 07.05.2020 (14,7%).

Минимальные значения отмечены на фоне об­щего снижения частоты детекции РНК SARS-CoV-2 и составили 2,7% (20.05.2020), 2,5% (21.05.2020) и 2,8% (24.05.2020). В Москве пиковые значения были несколько ниже и зафиксированы на уровне 11,9% (16.04.2020), 11,0% (17.04.2020), 11,9% (21.04.2020), 11,2% (28.04.2020) и 10,4% (08.05.2020). Миниму­мы также пришлись на заключительные дни пери­ода наблюдения — 23-24.05.2020 (1,8 и 1,9% соот­ветственно).

По характеру кривых значений частоты детек­ции РНК SARS-CoV-2 среди населения нами выде­лены три временных отрезка (06-28.04.2020, 29.04­12.05.2020 и 13-24.05.2020), для которых были рассчитаны величины тенденций динамики анали­зируемого показателя. Так, в период 06-28.04.2020 в Москве и Московской области зафиксирован уме­ренный рост с темпами прироста Троста = +1,3% и Троста = +3,0% в день соответственно. С нашей точки зрения, возрастающее количество потен­циальных источников инфекции свидетельству­ет об интенсификации эпидемического процесса COVID-19 в исследуемых субъектах России.

В середине периода наблюдения (29.04-12.05.2020) в Москве и Московской области выяв­лены различия в динамике анализируемого пока­зателя. Так, в Москве частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в популяции стала снижаться с уме­ренной интенсивностью (Тсниж. = -1,8% в день), тогда как в Московской области продолжился уме­ренный рост (Троста = +3,3% в день).

Заключительные 10 дней периода наблюдения характеризовались высокими темпами снижения частоты определения РНК SARS-CoV-2, которые в Москве и Московской области составили Троста = -5,9% и Тсниж. = -11,1% в день соответственно.

Вместе с тем положительная тенденция разви­тия эпидемического процесса COVID-19, установ­ленная на основании динамики частоты обнаруже­ния SARS-CoV-2 в популяции, не дает представле­ния об общем эпидемиологическом благополучии. Одним из показателей, который, по нашему мне­нию, количественно характеризует эпидемиологи­ческую ситуацию, является уровень циркуляции SARS-CoV-2 в популяции. Нами проведено срав­нение средней частоты обнаружения РНК SARS-CoV-2 у обследованных лиц за 7-9-дневные интер­валы с 06.04.2020 по 24.05.2020 (таблица).

 

Средняя частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 в Москве и Московской области за период 06.04-24.05.2020

The mean frequency of detection of SARS-CoV-2 RNA in Moscow and Moscow Region, 6/4/2020-24/5/2020

Срок исследования

Duration of study

Москва / Moscow

Московская область / Moscow Region

%

95% ДИ

95% confidence interval

%

95% ДИ

95% confidence interval

06-12.04.2020

7,04

6,13-8,04

11,66

10,09-13,39

28.04-04.05.2020

7,60

6,90-8,35

8,53

7,63-9,50

16-24.05.2020

3,30

2,93-3,70

3,39

3,06-3,75

Можно констатировать, что в течение всего периода наблюдения в Москве и Московской обла­сти достигнуто существенное (в 3-4 раза; р < 0,001) снижение удельного веса лиц, которые являлись потенциальными источниками инфекции, что, по нашему мнению, может служить предикцией даль­нейшего улучшения эпидемиологической ситуации.

Полученные данные свидетельствуют об эф­фективности проводимых противоэпидемических мероприятий. Так, принятый в Москве с 25.03.2020 режим самоизоляции начал оказывать значимый эффект, выражающийся в снижении удельного веса лиц, инфицированных SARS-CoV-2, примерно на 6-7-й неделе (рисунок). По нашему мнению, сроки начала влияния режима самоизоляции в Москве и начала снижения частоты обнаружения SARS-CoV-2 могут указывать на продолжительность инкубацион­ного периода COVID-19 более 14 дней, а также на длительное выделение вируса у реконвалесцентов, что требует тщательного научного анализа [1].

Вместе с тем такое улучшение эпидемиоло­гической ситуации недостаточно для радикальной отмены ограничительных мероприятий, поскольку, как очевидно, еще не сформирован достаточный популяционный иммунитет к РНК SARS-CoV-2. По предварительным данным, на этапе эпиде­мии, определяемом как стабилизация (по динами­ке заболеваемости COVID-19) — с 16.05.2020 по 24.05.2020, частота обнаружения специфических антител к SARS-CoV-2 у случайной выборки людей в Московском регионе составляет 12-15%, что пол­ностью коррелирует с полученными нами данными о частоте циркуляции вируса среди населения.

Определение РНК SARS-CoV-2 в различных группах пациентов имело высокую диагностиче­скую значимость. Так, у пациентов с предваритель­ным диагнозом «острая респираторная вирусная инфекция» в 81,65% (81,18-82,11%) случаев была выявлена РНК SARS-CoV-2. Это дает основания считать, что на фоне эпидемии COVID-19 этот эти­ологический агент является основным для данной нозологической формы. Среди пациентов с диагно­зом «пневмония», установленным на основании клинической картины, РНК SARS-CoV-2 обнару­жили в 70,92% (70,22-72,61%) случаев. Весьма вы­сокой следует считать частоту обнаружения РНК SARS-CoV-2 у лиц, имевших контакт с заболевши­ми COVID-19, — 65,78% (65,23-66,33%). Тот факт, что 2/3 контактных лиц оказались инфицированы, свидетельствует о высокой степени вирулентности SARS-CoV-2, что соответствует более поздней мо­дели распространения COVID-19 [2, 3]. Отдельную группу составили пациенты, обследование которых проведено по назначению врача. В период эпиде­мии частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 соста­вила 77,34% (76,53-78,13%).

Полученные результаты позволяют констати­ровать, что диагностика SARS-CoV-2 методом ПЦР в условиях развивающейся эпидемии COVID-19 на территории России имеет крайне важное и само­стоятельное значение. Во-первых, обследование на наличие РНК SARS-CoV-2 позволяет своевремен­но выявлять и изолировать потенциально опасных в эпидемиологическом отношении лиц, а также обеспечивать этиологическую дифференциальную диагностику с другими острыми респираторными заболеваниями и гриппом, что имеет принципиаль­но важное значение в качестве меры профилактики распространения SARS-CoV-2. Во-вторых, точное определение этиологии заболевания — необходи­мое условие для правильного выбора тактики веде­ния пациента. В-третьих, проведенное динамиче­ское популяционное исследование показало, что по­лучаемые результаты позволяют оценивать стадию развития эпидемического процесса COVID-19 [4].

В нашем случае в первую неделю (06­12.04.2020) частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 среди случайно выбранных здоровых людей со­ставила в Москве 7,04%, в Московской области — 11,66%. Это означало, что 1 из 10-13 человек, ко­торые считают себя здоровыми, инфицирован и является потенциальным источником заражения для других людей. Именно такие носители вируса поддерживали высокую интенсивность эпидемиче­ского процесса в Москве и Московской области.

В середине анализируемого периода (28.04­04.05.2020) в Москве частота обнаружения РНК SARS-CoV-2 осталась на прежнем уровне (7,60%), тогда как в Московской области отмечено некото­рое ее снижение (8,53%). Принципиально важным является существенное снижение удельного веса инфицированных лиц в последнюю неделю (16­24.05.2020). В Москве и Московской области РНК SARS-CoV-2 выявлена у 3,30 и 3,39% обследуемых лиц соответственно.

Таким образом, частота циркуляции SARS-CoV-2 в популяции — исключительно важный ин­тегративный эпидемиологический показатель, кото­рый позволяет объективно оценивать интенсивность эпидемического процесса и эффективность проводи­мых противоэпидемических мероприятий [5].

Массовый популяционный скрининг на на­личие РНК SARS-CoV-2 является важнейшим про­тивоэпидемическим мероприятием, позволяющим получить объективную информацию о развитии эпидемического процесса в режиме реального вре­мени. С учетом его значимости для оценки эпиде­миологической ситуации показатель удельного веса инфицированных лиц среди здоровой популяции, свидетельствующий об уровне циркуляции вируса среди населения, очевидно, будет использоваться в системе эпидемиологического надзора в качестве одного из параметров мониторинга [5, 6].

Список литературы

1. Zheng S., Fan J., Yu F., Feng B., Lou B., Zou Q., et al. Viral load dynamics and disease severity in patients infected with SARSCoV-2 in Zhejiang province, China, January–March 2020: retrospective cohort study. BMJ. 2020; 369: m1443. DOI: http://doi.org/10.1136/bmj.m1443

2. Sanche S., Lin Y.T., Xu C., Romero-Severson E., Hengartner N., Ke R. Contagiousness and rapid spread of severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2. Emerg. Infect. Dis. 2020; 26(7): 10.3201/eid2607.200282. DOI: http://doi.org/10.3201/eid2607.200282

3. Courtemanche C., Garuccio J., Le A., Pinkston J., Yelowitz A. Strong social distancing measures in the United States reduced the COVID-19 growth rate. Health Aff. (Millwood). 2020; 101377hlthaff202000608. DOI: http://doi.org/10.1377/hlthaff.2020.00608

4. Omori R., Mizumoto K., Chowell G. Changes in testing rates could mask the novel coronavirus disease (COVID-19) growth rate. Int. J. Infect. Dis. 2020; 94: 116‐8. DOI: http://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.04.021

5. Signorelli C., Scognamiglio T., Odone A. COVID-19 in Italy: impact of containment measures and prevalence estimates of infection in the general population. Acta Biomed. 2020; 91(3-S): 175‐9. DOI: http://doi.org/10.23750/abm.v91i3-S.9511

6. Shearer F.M., Moss R., McVernon J., Ross J.V., McCaw J.M. Infectious disease pandemic planning and response: Incorporating decision analysis. PLoS Med. 2020; 17(1): e1003018. DOI: http://doi.org/10.1371/journal.pmed.1003018


Об авторах

Василий Геннадиевич Акимкин
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Акимкин Василий Геннадиевич — д.м.н., академик РАН, директор


Станислав Николаевич Кузин
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Кузин Станислав Николаевич — д.м.н., проф., зав. лаб. вирусных гепатитов


Ольга Юрьевна Шипулина
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Шипулина Ольга Юрьевна — к.м.н., рук. подразделения лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Светлана Борисовна Яцышина
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Яцышина Светлана Борисовна — к.б.н., с.н.с., отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Елена Валерьевна Тиванова
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Тиванова Елена Валерьевна — рук. направления лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Анна Валентиновна Каленская
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Каленская Анна Валентиновна — зам. рук. направления лабораторной медицины и продвижения лабораторных услуг по клиентскому сервису отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Ирина Владимировна Соловьева
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Соловьева Ирина Владимировна — рук. группы обеспечения качества Клинико-диагностической лаборатории


Марина Анатольевна Вершинина
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Вершинина Марина Анатольевна — ведущий консультант по лабораторной медицине отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Ольга Андреевна Квасова
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Квасова Ольга Андреевна — врач-эпидемиолог лаборатории инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи


Антонина Александровна Плоскирева
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Плоскирева Антонина Александровна — д.м.н., зам. директора


Марина Васильевна Мамошина
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Мамошина Марина Васильевна — м.н.с. отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Мария Александровна Елькина
ФБУН «Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии» Роспотребнадзора
Россия
Елькина Мария Александровна — м.н.с. отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии


Елена Евгеньевна Андреева
Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по г. Москве
Россия
Андреева Елена Евгеньевна — д.м.н., проф., рук.


Александр Валентинович Иваненко
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в городе Москве»
Россия
Иваненко Александр Валентинович — главный врач


Ольга Михайловна Микаилова
Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Московской области
Россия
Микаилова Ольга Михайловна — к.м.н., рук.


Для цитирования:


Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Тиванова Е.В., Каленская А.В., Соловьева И.В., Вершинина М.А., Квасова О.А., Плоскирева А.А., Мамошина М.В., Елькина М.А., Андреева Е.Е., Иваненко А.В., Микаилова О.М. Эпидемиологическое значение определения РНК SARS-CoV-2 среди различных групп населения Москвы и Московской области в период эпидемии COVID-19. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2020;97(3):197-201. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

For citation:


Akimkin V.G., Kuzin S.N., Shipulina O.Yu., Yatsyshina S.B., Tivanova E.V., Kalenskaya A.V., Solovieva I.V., Vershinina M.A., Kvasova O.A., Ploskireva A.A., Mamoshina M.V., Elkina M.A., Andreeva E.E., Ivanenko A.V., Mikailova O.M. Epidemiological significance of detection of SARS-CoV-2 RNA among different groups of population of Moscow and Moscow Region during the COVID-19 outbreak. Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2020;97(3):197-201. (In Russ.) https://doi.org/10.36233/0372-9311-2020-97-3-1

Просмотров: 84


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0372-9311 (Print)
ISSN 2686-7613 (Online)