Preview

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

Расширенный поиск

РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГЕНЕТИЧЕСКОГО ЭЛЕМЕНТА ICE-emm12, СОДЕРЖАЩЕГО ГЕНЫ УСТОЙЧИВОСТИ tetM И ermB, СРЕДИ РОССИЙСКИХ И ВЬЕТНАМСКИХ ШТАММОВ СТРЕПТОКОККОВ ГРУППЫ А

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2018-2-23-30

Полный текст:

Аннотация

Цель. Характеристика и изучение распространенности генетического элемента ICE-emm12, ассоциированного со вспышками стрептококковых заболеваний в Юго-Восточной Азии, среди российских и вьетнамских штаммов СГА. Материалы и методы. Изучены 96 штаммов, выделенных в 2007 - 2014 гг. Молекулярно-генетические эксперименты проводили по опубликованным методикам. Полногеномное секвенирование осуществляли по технологии MiSeq. Результаты. На основе анализа данных высокопроцессивного секвенирования в геноме вьетнамского штамма V31 идентифицирован фрагмент (61028 п.н.), гомологичный интегративно-конъюгативному элементу ICE-emm12 и содержащий гены устойчивости к MLS-антибиотикам (ermB) и тетрациклину (tetM). Этот элемент обнаружен у 12 (26,1%, типы emm12.0, emm12.22) из 46 вьетнамских штаммов и у 2 (4,0%, типы emm12.0, emm88.2) из 50 российских штаммов. У 13 из 14 штаммов ICE-emm12 интегрирован в структурную область гена РНК-метилтрансферазы, являющегося «горячей точкой» рекомбинаций. Во всех штаммах ICE-emm12 обнаруживался в линейной интегрированной форме и в замкнутой циклической форме, что указывает на возможность его дальнейшего горизонтального переноса. Заключение. Обнаружение у российских штаммов ICE-emm12 элемента, способного к переносу генов устойчивости к антибиотикам с учетом активного развития туризма в страны Юго-Восточной Азии указывают на необходимость постоянного молекулярно-эпидемиологического надзора за циркуляцией клонов-возбудителей стрептококковых заболеваний в России.

Об авторах

А. Г. Киреева
Институт экспериментальной медицины; Санкт-Петербургский государственный университет
Россия


О. В. Калинина
Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А.Алмазова; Санкт-Петербургский государственный технологический институт «Технический университет»
Россия


А. М. Киселев
Северо-Западный федеральный медицинский исследовательский центр им. В.А.Алмазова
Россия


Н. И. Брико
Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Россия


Е. В. Глушкова
Первый московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова
Россия


А. В. Дмитриев
Институт экспериментальной медицины; Санкт-Петербургский государственный университет
Россия


Список литературы

1. Носик А.Г., Ильясов Ю.Ю., Линь Ф.К., Дмитриев А.В. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика стрептококков, выделенных у детей младшего школьного возраста во Вьетнаме. Журн. инфектологии. 2015, 7 (3): 112-118.

2. Полякова Е.М., Мнацаканян Е.С., Бурова Л.А., Дмитриев А.В. Генетическая гетерогенность штаммов Streptococcus pyogenes генотипа emm12. Медицинский академический журнал. 2010, 10 (1): 39-44.

3. Beres S.B., Musser J.M. Contribution of exogenous genetic elements to the group A Streptococcus metagenome. PLoS One. 2007, 2 (8): e800.

4. Carapetis J.R., Steer A.C., Mulholland E.K. et al. The global burden of group A streptococcal diseases. Lancet Infectious Diseases. 2005, 5 (11): 685-694.

5. Elliot J.A., Farmer K.D., Facklam R.R. Sudden increase in isolation of group B streptococci, serotype V, is not due to emergence of a new pulsed-field gel electrophoresis type. J. Clin. Microbiol. 1998, 36: 2115-2116.

6. Feng L.J., Lin H.R., Ma Y.L. et al. Macrolide-resistant Streptococcus pyogenes from Chinese pediatric patients in association with Tn916 transposons family over a 16-year period. Diagnostic Microbiology Infectious Disease. 2010, 67 (4): 369-375.

7. Guy R., Williams C., Irvine N. et al. Increase in scarlet fever notifications in the United Kingdom, 2013/14. Eurosurveillance. 2014, 19 (12): 20749.

8. Ip M., Lyon D.J., Leung T. et al. Macrolide resistance and distribution of erm and mef genes among beta-haemolytic streptococci in Hong Kong. European J. Clinical Microbiology Infectious Diseases. 2002, 21 (3): 238-240.

9. Kataja J., Huovinen P., Seppala H. Macrolide resistance study G. Erythromycin resistance genes in group A streptococci of different geographical origins. J. Antimicrobial Chemotherapy. 2000, 46 (5): 789-792.

10. Luk E.Y., Lo J.Y., Li A.Z. et al. Scarlet fever epidemic, Hong Kong, 2011. Emerging Infectious Diseases. 2012, 18 (10): 1658-1661.

11. Olivieri R., Morandi M., Zanchi A. et al. Evolution of macrolide resistance in Streptococcus pyogenes over 14 years in an area of central Italy. J. Medical Microbiology. 2015, 64: 11861195.

12. ProMED-Mail (2009, June 20). Streptococcus, group A, scarlet fever - Vietnam. Retrieved December 06, 2015.

13. Tse H., Bao J.Y.J., Davies M.R. et al. Molecular сharacterization of the 2011 Hong Kong Scarlet Fever Outbreak. J. Infectious Diseases. 2012, 206 (3): 341-351.

14. Varaldo P.E., Montanari M.P., Giovanetti E. Genetic elements responsible for erythromycin resistance in streptococci, Antimicrobial Agents Chemotherapy. 2009, 53: 343-353.

15. Yan J.J., Wu H.M., Huang A.H. et al. Prevalence of polyclonal mefA-containing isolates among erythromycin-resistant group A streptococci in southern Taiwan. J. Clinical Microbiology. 2000, 38 (7): 2475-2479.


Просмотров: 175


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0372-9311 (Print)
ISSN 2686-7613 (Online)