Журналов:     Статей:        

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2017; : 59-66

МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ ПРИ РАССЛЕДОВАНИИ СЛУЧАЯ ПЕРЕДАЧИ ВИЧ-ИНФЕКЦИИ

Семенов А. В., Останкова Ю. В., Чурина М. А., Никитина Н. А., Росоловский А. П., Гребенкина Е. В., Ткаченко Т. Н., Жандармова Т. А., Тотолян А. А.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-4-59-66

Аннотация

Цель. Эпидемиологическое расследование случая группового инфицирования ВИЧ-1 на основании данных, полученных общепринятыми методами диагностики, для подтверждения следственной гипотезы об умышленном инфицировании ВИЧ при гетеросексуальном контакте. Материалы и методы. Были использованы образцы плазмы крови 8 пациентов с ВИЧ-инфекцией (5 женщин и 3 мужчин) из г. Великий Новгород, направленные для проведения эпидемиологического расследования. Определение проводили на основе анализа нуклеотидных последовательностей участка гена полимеразы (pol) протяженностью 1285 нт. Результаты. Проведенное исследование позволило идентифицировать ВИЧ в клинических образцах, отправленных на экспертизу, и установить филогенетические связи между изолятами вируса, полученными как от пациентов целевой группы, так и от пациентов контрольной группы. При анализе полученных результатов можно выделить образцы, сгруппированные в отдельный кластер, что указывает на тесные родственные связи изолятов вируса, выделенного из клинического материала этих пациентов, между собой. Пациенты целевой группы заражены изолятом ВИЧ-1 циркулирующей рекомбинантной формы CRF03AB, происходящим из одного источника, что подтверждается высокой гомологией нуклеотидных последовательностей. Заключение. В ходе эпидемиологического расследования случая группового инфицирования ВИЧ-1 было определено, что заражение женщин целевой группы произошло из одного источника. Результаты филогенетического анализа указывают на наличие эпидемиологической связи внутри обследуемой группы, что подтверждает случай передачи ВИЧ-инфекции и выводы, сделанные в ходе следствия. Использование для молекулярно-филогенетического анализа данных, полученных методами лабораторной диагностики резистентности ВИЧ к антиретровирусным препаратам, позволяет в сочетании с анамнестической и следственной информацией (в контексте имеющихся доказательств) расследовать случаи инфицирования ВИЧ.
Список литературы

1. ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31 декабря 2015 г. Федеральный центр СПИД. URL: httphttp://www.hivrussia.ru/news/index.shtml. Дата обращения 24.02.2016.

2. Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н. и др. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011, 3 (4): 34-44.

3. Зайцева Н.Н., Пекшева О.Ю., Парфенова О.В. и др. Современные молекулярногенетические технологии в надзоре за циркуляцией субтипов ВИЧ-1. Современные технологии в медицине. 2016, 8 (1): 121-127.

4. Плавинский С.Л., Баринова А.Н., Бобрик А.В. и др. Сексуальное поведение ВИЧ-инфицированных лиц группы риска. Необходимость дальнейшего усиления профилактической работы. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2009, 1: 102-108.

5. Смольская Т.Т., Огурцова С.В. ВИЧ-инфекция в Северо-Западном федеральном округе РФ в 2009 г. Инфекция и иммунитет. 2011, 1 (4): 311-318.

6. Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987-2009 гг. ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011, 3 (1): 27-36.

7. Тулупьева Т.В., Тулупьев А.Л., Пащенко А.Е. и др. Психологическая защита и копинг-стратегии ВИЧ-инфицированных с позиции опасности для общественного здоровья: автоматизация сбора данных и итоги исследования. Труды СПИИРАН. 2007, 4: 357-387.

8. Фаргиев И. Уголовно-правовая оценка заражения венерической болезнью. Уголовное право. 2010, 1: 42-44.

9. Azam М., Malik A., Rizvi М. et al. Emergence of drug resistance-associated mutations in HIV-1 subtype C protease gene in North India. Virus Genes. 2013, 47 (3): 422-428.

10. Bernard E.J., Azad Y., Vandamme A.M. et al. HIV forensics: pitfalls and acceptable standards in the use of phylogenetic analysis as evidence in criminal investigations of HIV transmission. HIV Med. 2007, 8 (6): 382-387.

11. Krishnan K.M., Amsavathani S. Polymorphisms ofHIVRT gene among the ART naive native drug exposed rural PLHA. J. Glob. Infect. Dis. 2012, 4 (2): 110-113.

12. Machuca R., Jorgensen L.B., Theilade P. et al. Molecular investigation of transmission of human immunodeficiency virus type 1 in a criminal case. Clin. Diagn. Lab. Immunol. 2001, 8 (5): 884-890.

13. Masquelier B., Droz C., Dary M. et al. R57K polymorphism in the human immunodeficiency virus type 1 protease as predictor of early virological failure in a cohort of antiretroviralnaive patients treated mostly with a nelfinavir-containing regimen. Antimicrob. Agents Chemother. 2003, 47 (11): 3623-3626.

14. Mohanakrishnan K., Kasthuri A., Amsavathani S.K. et al. HIV reverse transcriptase gene mutations in anti-retroviral treatment naive rural people living with HIV/AIDS. Indian J. Med. Microbiol. 2015, 33 (4): 565-567.

15. Shanmugasundaram U., Solomon S., Madhavan V. et al. Analysis of selection pressure and mutational pattern of HIV type 1 reverse transcriptase region among treated and nontreated patients. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2010, 26 (10): 1093-1096.

16. Smolskaya T, Liitsola K., Zetterberg V. et al. HIV epidemiology in the Northwestern Federal District of Russia: Dominance of HIV type 1 subtvpe A. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2006, 22(11): 1074-1080.

17. Tamura K., Peterson D., Peterson N. MEGA 5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011, 28 (10): 2731-2739.

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2017; : 59-66

MOLECULAR-BIOLOGICAL METHODS OF DIAGNOSTICS FOR INVESTIGATION OF HIV INFECTION TRANSMISSION

Semenov A. V., Ostankova Yu. V., Churina M. A., Nikitina N. A., Rosolovsky A. P., Grebenkina E. V., Tkachenko T. N., Zhandarmova T. A., Totolyan A. A.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-4-59-66

Abstract

Aim. Epidemiologic examination of the case of group HIV-1 infection based on data obtained by general diagnostics methods for confirmation of the investigation hypothesis of deliberate HIV infection during heterosexual intercourse. Materials and methods. Sera samples from 8 HIV infected patients (5 female and 3 male) from Veliky Novgorod sent for epidemiologic investigation were used. Determination was carried out based on 1285 nt sequence analysis of polymerase gene segment (pol). Results. The study allowed to identify HIV in clinical samples sent to the expertise and establish phylogenetic connections between virus isolates obtained from both target and control group patients. Analysis of the results allowed to isolate samples grouped in a separate cluster that indicates tight cordial connections between the vims isolates from clinical material of these patients. Patients of the target group were infected with HIV-1 isolate ofthe circulating recombinant form CRF03_AB from the same origin that is confirmed by high homology ofthe nucleotide sequences. Conclusion. Epidemiologic investigation of a group case of HIV-1 infection has determined that the infection of the women of the target group occurred from the same source. Phylogenetic analysis results indicate the presence of an epidemiologic connection within the examined group that confirms the HIV infection transmission and conclusions ofthe investigation. Use of molecular-phylogenetic analysis of data obtained by laboratory diagnostics methods of HIV resistance to antiretroviral preparations allows with anamnestic and investigation information (in the context of available evidence) to investigate cases of HIV infection.
References

1. VICh-infektsiya v Rossiiskoi Federatsii na 31 dekabrya 2015 g. Federal'nyi tsentr SPID. URL: httphttp://www.hivrussia.ru/news/index.shtml. Data obrashcheniya 24.02.2016.

2. Dement'eva N.E., Sizova N.V., Lisitsina Z.N. i dr. Analiz subtipov i farmakorezistentnykh variantov VICh, tsirkuliruyushchikh sredi VICh-infitsirovannykh patsientov Sankt-Peterburga. VICh-infektsiya i immunosupressii. 2011, 3 (4): 34-44.

3. Zaitseva N.N., Peksheva O.Yu., Parfenova O.V. i dr. Sovremennye molekulyarnogeneticheskie tekhnologii v nadzore za tsirkulyatsiei subtipov VICh-1. Sovremennye tekhnologii v meditsine. 2016, 8 (1): 121-127.

4. Plavinskii S.L., Barinova A.N., Bobrik A.V. i dr. Seksual'noe povedenie VICh-infitsirovannykh lits gruppy riska. Neobkhodimost' dal'neishego usileniya profilakticheskoi raboty. VICh-infektsiya i immunosupressii. 2009, 1: 102-108.

5. Smol'skaya T.T., Ogurtsova S.V. VICh-infektsiya v Severo-Zapadnom federal'nom okruge RF v 2009 g. Infektsiya i immunitet. 2011, 1 (4): 311-318.

6. Smol'skaya T.T., Ogurtsova S.V. Obzor sostoyaniya epidemii VICh-infektsii v Severo-Zapadnom federal'nom okruge RF v 1987-2009 gg. VICh-infektsiya i immunosupressii. 2011, 3 (1): 27-36.

7. Tulup'eva T.V., Tulup'ev A.L., Pashchenko A.E. i dr. Psikhologicheskaya zashchita i koping-strategii VICh-infitsirovannykh s pozitsii opasnosti dlya obshchestvennogo zdorov'ya: avtomatizatsiya sbora dannykh i itogi issledovaniya. Trudy SPIIRAN. 2007, 4: 357-387.

8. Fargiev I. Ugolovno-pravovaya otsenka zarazheniya venericheskoi bolezn'yu. Ugolovnoe pravo. 2010, 1: 42-44.

9. Azam M., Malik A., Rizvi M. et al. Emergence of drug resistance-associated mutations in HIV-1 subtype C protease gene in North India. Virus Genes. 2013, 47 (3): 422-428.

10. Bernard E.J., Azad Y., Vandamme A.M. et al. HIV forensics: pitfalls and acceptable standards in the use of phylogenetic analysis as evidence in criminal investigations of HIV transmission. HIV Med. 2007, 8 (6): 382-387.

11. Krishnan K.M., Amsavathani S. Polymorphisms ofHIVRT gene among the ART naive native drug exposed rural PLHA. J. Glob. Infect. Dis. 2012, 4 (2): 110-113.

12. Machuca R., Jorgensen L.B., Theilade P. et al. Molecular investigation of transmission of human immunodeficiency virus type 1 in a criminal case. Clin. Diagn. Lab. Immunol. 2001, 8 (5): 884-890.

13. Masquelier B., Droz C., Dary M. et al. R57K polymorphism in the human immunodeficiency virus type 1 protease as predictor of early virological failure in a cohort of antiretroviralnaive patients treated mostly with a nelfinavir-containing regimen. Antimicrob. Agents Chemother. 2003, 47 (11): 3623-3626.

14. Mohanakrishnan K., Kasthuri A., Amsavathani S.K. et al. HIV reverse transcriptase gene mutations in anti-retroviral treatment naive rural people living with HIV/AIDS. Indian J. Med. Microbiol. 2015, 33 (4): 565-567.

15. Shanmugasundaram U., Solomon S., Madhavan V. et al. Analysis of selection pressure and mutational pattern of HIV type 1 reverse transcriptase region among treated and nontreated patients. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2010, 26 (10): 1093-1096.

16. Smolskaya T, Liitsola K., Zetterberg V. et al. HIV epidemiology in the Northwestern Federal District of Russia: Dominance of HIV type 1 subtvpe A. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2006, 22(11): 1074-1080.

17. Tamura K., Peterson D., Peterson N. MEGA 5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Mol. Biol. Evol. 2011, 28 (10): 2731-2739.