Журналов:     Статей:        

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2022; 99: 269-286

COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение I: проявления эпидемического процесса COVID-19

Акимкин В. Г., Попова А. Ю., Плоскирева А. А., Углева С. В., Семененко Т. А., Пшеничная Н. Ю., Ежлова Е. Б., Летюшев А. Н., Демина Ю. В., Кузин С. Н., Дубоделов Д. В., Хафизов К. Ф., Заволожин В. А., Андреева Е. Е., Микаилова О. М., Дятлов И. А., Кутырев В. В., Троценко О. Е., Балахонов С. В., Рудаков Н. В., Куличенко А. Н., Максютов Р. А., Тотолян А. А., Носков А. К., Зайцева Н. Н., Ананьев В. Ю., Ковалев Е. В., Молдованов В. В., Воронин Е. М., Кравцов О. А., Глазов М. Б., Остроушко А. А., Гасанов Г. А., Сванадзе Н. Х., Корабельникова М. И., Клушкина В. В., Черкашина А. С., Миронов К. О., Есьман А. С., Сычева Н. В., Овчинникова В. С., Лукьянов А. В., Мурадова А. А.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-276

Аннотация

Актуальность. Продолжающаяся пандемия новой коронавирусной инфекции (COVID-19) определяет актуальность анализа эпидемиологических закономерностей распространения SARS-CoV-2 среди населения России.

Цель данной статьи — изучение проявлений эпидемического процесса COVID-19 на территории РФ за 2020–2022 гг.

Материалы и методы. Проведён ретроспективный эпидемиологический анализ заболеваемости COVID-19 с 30.03.2020 по 24.04.2022 на территории РФ. Использованы материалы отчёта Роспотребнадзора № 970 «Информация о случаях инфекционных заболеваний у лиц с подозрением на новую коронавирусную инфекцию», информационного портала Стопкоронавирус.рф и др. Наличие РНК SARS-CoV-2 было подтверждено методом полимеразной цепной реакции в реальном времени с обратной транскрипцией.

Результаты и обсуждение. При анализе проявлений эпидемического процесса COVID-19 на территории РФ за 2020–2022 гг. выделены два этапа, различавшиеся влиянием биологического фактора и проводимыми противоэпидемическими мероприятиями. Прослеживается выраженная тенденция развития эпидемического процесса, начиная от мегаполисов (Москва, Московская область и Санкт-Петербург), являющихся крупными транспортными узлами и центрами миграционной активности населения, до регионов РФ. Установлено, что с каждым последующим циклом подъёма заболеваемости COVID-19 на фоне усиления контагиозности SARS-CoV-2 снижается его патогенность.

Заключение. Выявлены территории риска (города-мегаполисы), группы риска, факторы, влияющие на развитие эпидемического процесса. Определены закономерности распространения SARS-CoV-2 и оценена эффективность противоэпидемических мероприятий, направленных на разрыв механизма передачи возбудителя.

Список литературы

1. Corman V.M., Muth D., Niemeyer D., Drosten C. Hosts and sources of endemic human coronaviruses. Adv. Vir. Res. 2018; 100: 163–88. https://doi.org/10.1016/bs.aivir.2018.01.001

2. Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., Yang B., Wu H., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224): 565–74. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8

3. Щелканов М.Ю., Попова А.Ю., Дедков В.Г., Акимкин В.Г., Малеев В.В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae). Инфекция и иммунитет. 2020; 10(2): 221–46. https://doi.org/10.15789/2220-7619-HOI-1412

4. Romagnani P., Gnone G., Guzzi F., Negrini S., Guastalla A., Annunziato F., et al. The COVID-19 infection: lessons from the Italian experience. J. Public Health Policy. 2020; 41(3): 238– 44. https://doi.org/10.1057/s41271-020-00229-y

5. Sebastian G., Massa M., Riboli E. COVID-19 epidemic in Italy: evolution, projections and impact of government measures. Eur. J. Epidemiol. 2020; 35(4): 341–5. https://doi.org/10.1007/s10654-020-00631-6

6. Rothe C., Schunk M., Sothmann P., Bretzel G., Froeschl G., Wallrauch C., et al. Transmission of 2019-nCoV infection from an asymptomatic contact in Germany. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 970–1. https://doi.org/10.1056/NEJMc200146

7. Holshue M.L., DeBolt C., Lindquist S., Lofy K., Wiesman J., Bruce H., et al. First case of 2019 novel coronavirus in the United States. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 929–36. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001191

8. Wang C.J., Ng C.Y., Brook R.H. Response to COVID-19 in Taiwan: big data analytics, new technology, and proactive testing. JAMA. 2020; 323(14): 1341–2. https://doi.org/10.1001/jama.2020.3151

9. Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А, Журавлев Г.Ю., Плоскирева А.А., Акимкин В.Г. Эпидемический процесс COVID-19 в Российской Федерации: промежуточные итоги. Сообщение 1. Инфекционные болезни. 2020; 18(3): 7–14. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2020-3-7-14

10. Lauer S.A., Grantz K.H., Bi Q., Jones F.K., Zheng Q., Meredith H.R., et al. The incubation period of coronavirus disease 2019 (COVID-19) from publicly reported confirmed cases: estimation and application. Ann. Intern. Med. 2020; 172(9): 577–82. https://doi.org/10.7326/M20-0504

11. Raifman J., Nocka K., Jones D., Bo J., Lipson S., Jay J., et al. COVID-19 US State Policy Database. Ann Arbor, MI: Inter-university Consortium for Political and Social Research; 2020. https://doi.org/10.3886/E119446V1

12. Fang L., Karakiulakis G., Roth M. Are patients with hypertension and diabetes mellitus at increased risk for COVID-19 infection? Lancet. Respir. Med. 2020; 8(4): e21. https://doi.org/10.1016/S2213-2600(20)30116-8

13. Liang W.H., Guan W.J., Li C.C., Li Y.M., Liang H.R., Zhao Y., et al. Clinical characteristics and outcomes of hospitalised patients with COVID-19 treated in Hubei (epicentre) and outsideHubei (non-epicentre): a nationwide analysis of China. Eur. Respir. J. 2020; 55(6): 2000562. https://doi.org/10.1183/13993003.00562-2020

14. Ting D.S., Carin L., Dzau V., Wong T.Y. Digital technology and COVID-19. Nat. Med. 2020; 26(4): 459–61. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0824-5

15. Кутырев В.В., Попова А.Ю., Смоленский В.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Сафронов В.А. и др. Эпидемиологические особенности новой коронавирусной инфекции (COVID-19). Сообщение 1: Модели реализации профилактических и противоэпидемических мероприятий. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; (1): 6–13. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-1-6-13

16. Попова А.Ю., ред. COVID-19: научно-практические аспекты борьбы с пандемией в Российской Федерации. Саратов: Амирит; 2021.

17. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Колосовская Е.Н., Кудрявцева Е.Н., Семененко Т.А., Плоскирева А.А. и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Санкт-Петербурге. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021; 98(5): 497–511. https://doi.org/10.36233/0372-9311-154

18. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., Плоскирева А.А., Дубоделов Д.В., Тиванова Е.В. и др. Характеристика эпидемиологической ситуации по COVID-19 в Российской Федерации в 2020 г. Вестник Российской академии медицинских наук. 2021; 76(4): 412–22. https://doi.org/10.15690/vramn1505

19. Задорожный А.В., Пшеничная Н.Ю., Углева С.В., Еровиченков А.А., Акимкин В.Г., Малеев В.В. Сравнительный анализ заболеваемости COVID-19 среди населения Москвы и в организованных коллективах в учреждениях общественного проживания в период пандемии. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2021; 11(2): 36–41. https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.2.36-41

20. Пшеничная Н.Ю., Лизинфельд И.А., Журавлев Г.Ю., Плоскирева А.А., Еровиченков А.А., Акимкин В.Г. Эпидемический процесс COVID-19 в Российский Федерации: промежуточные итоги. Сообщение 2. Инфекционные болезни. 2021; 19(1): 10–5. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2021-1-10-15

21. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., Шипулина О.Ю., Яцышина С.Б., Тиванова Е.В. и др. Закономерности эпидемического распространения SARS-CoV-2 в условиях мегаполиса. Вопросы вирусологии. 2020; 65(4): 203–11. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-4-203-211

22. Kaptelova V .V., Bukharina A.Y., Shipulina O.Y., Korneenko E.V., Saenko S.S., Lukyanov A.V., et al. Case report: change of dominant strain during dual SARS-CoV-2 infection. BMC Infect. Dis. 2021; 21(1): 959. https://doi.org/10.1186/s12879-021-06664-w

23. Борисова Н.И., Котов И.А., Колесников А.А., Каптелова В.В., Сперанская А.С., Кондрашева Л.Ю. и др. Мониторинг распространения вариантов SARS-CoV-2 (Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus; Sarbecovirus) на территории Московского региона с помощью таргетного высокопроизводительного секвенирования. Вопросы вирусологии. 2021; 66(4): 269–78. https://doi.org/10.36233/0507-4088-72

24. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А., Плоскирева А.А., Дубоделов Д.В., Тиванова Е.В. и др. Гендерно-возрастная характеристика пациентов с COVID-19 на разных этапах эпидемии в Москве. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; (3): 27–35. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-27-35

25. Беляков В.Д. Внутренняя регуляция эпидемического процесса (ответы на замечания и вопросы, поднятые при обсуждении теории). Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 1987; 64(10): 78–89.

26. Беляков В.Д., Голубев Д.Б., Каминский Г.Д., Тец В.В. Саморегуляция паразитарных систем. Ленинград: Медицина; 1987.

Journal of microbiology, epidemiology and immunobiology. 2022; 99: 269-286

COVID-19: the evolution of the pandemic in Russia. Report I: manifestations of the COVID-19 epidemic process

Akimkin V. G., Popova A. Yu., Ploskireva A. A., Ugleva S. V., Semenenko T. A., Pshenichnaya N. Yu., Ezhlova E. B., Letyushev A. N., Demina Yu. V., Kuzin S. N., Dubodelov D. V., Khafizov K. F., Zavolozhin V. А., Andreeva E. A., Mikailova O. M., Dyatlov I. A., Kutyrev V. V., Trotsenko O. E., Balakhonov S. V., Rudakov N. V., Kulichenko A. N., Maksyutov R. A., Totolyan A. A., Noskov A. K., Zaitseva N. N., Ananyev V. Yu., Kovalev E. V., Moldovanov V. V., Voronin E. M., Kravtsova O. A., Glazov M. B., Ostroushko A. A., Gasanov G. A., Svanadze N. Kh., Korabelnikova M. I., Klushkina V. V., Cherkashina A. S., Mironov K. O., Esman A. S., Sycheva N. V., Ovchinnikova V. S., Lukyanov A. V., Muradova A. A.

https://doi.org/10.36233/0372-9311-276

Abstract

Background. The ongoing pandemic of a new coronavirus infection (COVID-19) determines the relevance of the analysis of epidemiological patterns of SARS-CoV-2 spread among the population of the Russian Federation.

Aim — study of the manifestations of the epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation in 2020–2022.

Materials and methods. A retrospective epidemiological analysis of the incidence of COVID-19 in the Russian Federation was carried out from 03/30/2020 to 04/24/2022. The data from the Rospotrebnadzor report No. 970 “Information on cases of infectious diseases in persons with suspected new coronavirus infection”, information portal Stopcoronavirus.rf, etc. were used. The presence of SARS-CoV-2 RNA was confirmed by real-time RT-PCR.

Results and discussion. The analysis of the manifestations of the epidemic process of COVID-19 in the Russian Federation in 2020–2022 showed the presence of two stages which differed depending on the influence of the biological factor and the ongoing anti-epidemic measures. There was a pronounced trend in the development of the epidemic process, starting from megacities (Moscow, Moscow region and St. Petersburg), which are major transport hubs and centers of migration activity of the population, to the regions of the Russian Federation. The SARS-CoV-2 pathogenicity has been shown to decrease with each subsequent cycle of the rise in the incidence of COVID-19 against the background of the increased contagiousness of the virus.

Conclusion. As a result of the study, risk areas (megacities) and risk groups were identified.

References

1. Corman V.M., Muth D., Niemeyer D., Drosten C. Hosts and sources of endemic human coronaviruses. Adv. Vir. Res. 2018; 100: 163–88. https://doi.org/10.1016/bs.aivir.2018.01.001

2. Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., Yang B., Wu H., et al. Genomic characterization and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395(10224): 565–74. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8

3. Shchelkanov M.Yu., Popova A.Yu., Dedkov V.G., Akimkin V.G., Maleev V.V. Istoriya izucheniya i sovremennaya klassifikatsiya koronavirusov (Nidovirales: Coronaviridae). Infektsiya i immunitet. 2020; 10(2): 221–46. https://doi.org/10.15789/2220-7619-HOI-1412

4. Romagnani P., Gnone G., Guzzi F., Negrini S., Guastalla A., Annunziato F., et al. The COVID-19 infection: lessons from the Italian experience. J. Public Health Policy. 2020; 41(3): 238– 44. https://doi.org/10.1057/s41271-020-00229-y

5. Sebastian G., Massa M., Riboli E. COVID-19 epidemic in Italy: evolution, projections and impact of government measures. Eur. J. Epidemiol. 2020; 35(4): 341–5. https://doi.org/10.1007/s10654-020-00631-6

6. Rothe C., Schunk M., Sothmann P., Bretzel G., Froeschl G., Wallrauch C., et al. Transmission of 2019-nCoV infection from an asymptomatic contact in Germany. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 970–1. https://doi.org/10.1056/NEJMc200146

7. Holshue M.L., DeBolt C., Lindquist S., Lofy K., Wiesman J., Bruce H., et al. First case of 2019 novel coronavirus in the United States. N. Engl. J. Med. 2020; 382(10): 929–36. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001191

8. Wang C.J., Ng C.Y., Brook R.H. Response to COVID-19 in Taiwan: big data analytics, new technology, and proactive testing. JAMA. 2020; 323(14): 1341–2. https://doi.org/10.1001/jama.2020.3151

9. Pshenichnaya N.Yu., Lizinfel'd I.A, Zhuravlev G.Yu., Ploskireva A.A., Akimkin V.G. Epidemicheskii protsess COVID-19 v Rossiiskoi Federatsii: promezhutochnye itogi. Soobshchenie 1. Infektsionnye bolezni. 2020; 18(3): 7–14. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2020-3-7-14

10. Lauer S.A., Grantz K.H., Bi Q., Jones F.K., Zheng Q., Meredith H.R., et al. The incubation period of coronavirus disease 2019 (COVID-19) from publicly reported confirmed cases: estimation and application. Ann. Intern. Med. 2020; 172(9): 577–82. https://doi.org/10.7326/M20-0504

11. Raifman J., Nocka K., Jones D., Bo J., Lipson S., Jay J., et al. COVID-19 US State Policy Database. Ann Arbor, MI: Inter-university Consortium for Political and Social Research; 2020. https://doi.org/10.3886/E119446V1

12. Fang L., Karakiulakis G., Roth M. Are patients with hypertension and diabetes mellitus at increased risk for COVID-19 infection? Lancet. Respir. Med. 2020; 8(4): e21. https://doi.org/10.1016/S2213-2600(20)30116-8

13. Liang W.H., Guan W.J., Li C.C., Li Y.M., Liang H.R., Zhao Y., et al. Clinical characteristics and outcomes of hospitalised patients with COVID-19 treated in Hubei (epicentre) and outsideHubei (non-epicentre): a nationwide analysis of China. Eur. Respir. J. 2020; 55(6): 2000562. https://doi.org/10.1183/13993003.00562-2020

14. Ting D.S., Carin L., Dzau V., Wong T.Y. Digital technology and COVID-19. Nat. Med. 2020; 26(4): 459–61. https://doi.org/10.1038/s41591-020-0824-5

15. Kutyrev V.V., Popova A.Yu., Smolenskii V.Yu., Ezhlova E.B., Demina Yu.V., Safronov V.A. i dr. Epidemiologicheskie osobennosti novoi koronavirusnoi infektsii (COVID-19). Soobshchenie 1: Modeli realizatsii profilakticheskikh i protivoepidemicheskikh meropriyatii. Problemy osobo opasnykh infektsii. 2020; (1): 6–13. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-1-6-13

16. Popova A.Yu., red. COVID-19: nauchno-prakticheskie aspekty bor'by s pandemiei v Rossiiskoi Federatsii. Saratov: Amirit; 2021.

17. Akimkin V.G., Kuzin S.N., Kolosovskaya E.N., Kudryavtseva E.N., Semenenko T.A., Ploskireva A.A. i dr. Kharakteristika epidemiologicheskoi situatsii po COVID-19 v Sankt-Peterburge. Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 2021; 98(5): 497–511. https://doi.org/10.36233/0372-9311-154

18. Akimkin V.G., Kuzin S.N., Semenenko T.A., Ploskireva A.A., Dubodelov D.V., Tivanova E.V. i dr. Kharakteristika epidemiologicheskoi situatsii po COVID-19 v Rossiiskoi Federatsii v 2020 g. Vestnik Rossiiskoi akademii meditsinskikh nauk. 2021; 76(4): 412–22. https://doi.org/10.15690/vramn1505

19. Zadorozhnyi A.V., Pshenichnaya N.Yu., Ugleva S.V., Erovichenkov A.A., Akimkin V.G., Maleev V.V. Sravnitel'nyi analiz zabolevaemosti COVID-19 sredi naseleniya Moskvy i v organizovannykh kollektivakh v uchrezhdeniyakh obshchestvennogo prozhivaniya v period pandemii. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2021; 11(2): 36–41. https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.2.36-41

20. Pshenichnaya N.Yu., Lizinfel'd I.A., Zhuravlev G.Yu., Ploskireva A.A., Erovichenkov A.A., Akimkin V.G. Epidemicheskii protsess COVID-19 v Rossiiskii Federatsii: promezhutochnye itogi. Soobshchenie 2. Infektsionnye bolezni. 2021; 19(1): 10–5. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2021-1-10-15

21. Akimkin V.G., Kuzin S.N., Semenenko T.A., Shipulina O.Yu., Yatsyshina S.B., Tivanova E.V. i dr. Zakonomernosti epidemicheskogo rasprostraneniya SARS-CoV-2 v usloviyakh megapolisa. Voprosy virusologii. 2020; 65(4): 203–11. https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-4-203-211

22. Kaptelova V .V., Bukharina A.Y., Shipulina O.Y., Korneenko E.V., Saenko S.S., Lukyanov A.V., et al. Case report: change of dominant strain during dual SARS-CoV-2 infection. BMC Infect. Dis. 2021; 21(1): 959. https://doi.org/10.1186/s12879-021-06664-w

23. Borisova N.I., Kotov I.A., Kolesnikov A.A., Kaptelova V.V., Speranskaya A.S., Kondrasheva L.Yu. i dr. Monitoring rasprostraneniya variantov SARS-CoV-2 (Coronaviridae: Coronavirinae: Betacoronavirus; Sarbecovirus) na territorii Moskovskogo regiona s pomoshch'yu targetnogo vysokoproizvoditel'nogo sekvenirovaniya. Voprosy virusologii. 2021; 66(4): 269–78. https://doi.org/10.36233/0507-4088-72

24. Akimkin V.G., Kuzin S.N., Semenenko T.A., Ploskireva A.A., Dubodelov D.V., Tivanova E.V. i dr. Genderno-vozrastnaya kharakteristika patsientov s COVID-19 na raznykh etapakh epidemii v Moskve. Problemy osobo opasnykh infektsii. 2020; (3): 27–35. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-27-35

25. Belyakov V.D. Vnutrennyaya regulyatsiya epidemicheskogo protsessa (otvety na zamechaniya i voprosy, podnyatye pri obsuzhdenii teorii). Zhurnal mikrobiologii, epidemiologii i immunobiologii. 1987; 64(10): 78–89.

26. Belyakov V.D., Golubev D.B., Kaminskii G.D., Tets V.V. Samoregulyatsiya parazitarnykh sistem. Leningrad: Meditsina; 1987.