Preview

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

Расширенный поиск

ИДЕНТИФИКАЦИЯ СЕРОВАРОВ LEPTOSPIRA МЕТОДОМ MALDI-TOF МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ

https://doi.org/10.36233/0372-9311-2017-1-42-49

Полный текст:

Аннотация

Цель. Попытка использования метода MALD1-TOF масс-спектрометриидля идентификации изолятов лептоспир на уровне сероваров. Материалы и методы. В исследование были включены 8 референсных штаммов Leptospira spp. и 11 штаммов лептоспир, выделенных от больных лептоспирозом и инфицированных животных в Северо-Западном регионе России. Масс-спектры всех исследуемых штаммов получали прямым профилированием клеточных экстрактов. Созданные главные спектральные профили (MSP) референсных штаммов использовали для идентификации изолятов. Оценку идентификации осуществляли путем вычисления коэффициентов совпадения отдельных спектров каждого изолята с MSP всех референсных штаммов. Результаты. Результаты идентификации показали схожесть спектров изолятов, относящихся к серогруппам Pomona, Ictero-haemorrhagiae и Canicola, с MSP сапрофитного штамма L. biflexa Patoc I. Предполагается, что спектры исследуемых штаммов содержали в своем составе пики полисахаридных О-антигенов. При этом максимальные средние значения коэффициентов совпадения между спектрами изолятов и MSP патогенных референсных штаммов лептоспир правильно совпадали с типом серовара изолята. Заключение. Дальнейшие расширенные исследования могут быть положены в основу разработки быстрого и простого метода типирования возбудителей лептоспироза на уровне сероваров с использованием MALDI-TOF масс-спектрометрии.

Об авторах

Е. В. Зуева
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
Россия


Н. А. Стоянова
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
Россия


Н. К. Токаревич
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, С.-Петербург
Россия


А. А. Тотолян
НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера, Первый С.-Петербургский государственный медицинский университет им. И.П.Павлова
Россия


Список литературы

1. Ананьина Ю.В. Лептоспирозы в Российской Федерации: современные особенности эпидемического проявления природных и техногенных очагов. Ветеринарная патология 2004, 4: 54-57.

2. Ананьина Ю.В., Петров Е.М. Лептоспирозы в России: этиологическая структура и современная этиология. Пест-Менеджмент 2006, 1: 8-10.

3. Бренева Н.В., Афанасьев М.В., Шаракшанов М.Б. и др. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ клеточных белков в идентификации представителей Leptospira. Журн. микробиол. 2014, 4: 36-43.

4. Зуева Е.В., Стоянова Н.А., Токаревич Н.К., Тотолян Арег A. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ штаммов Leptospira spp., используемых в серодиагностике лептоспироза. Журн. микробиол. 2015, 6: 28-36.

5. Останкова Ю.В., Семенов А.В., Стоянова Н.А., Токаревич Н.К. и др. Типирование штаммов Leptospira spp. на основе 16S rRNA. Журн. микробиол. 2016, 1: 35-39.

6. Эпидемиология, диагностика и профилактика заболеваний лептоспирозами. Методические указания 3.1.1128-02. М., М3 РФ, 2002.

7. Addamiano L, Babudieri В. Water strains of Leptospira in the serodiagnosis of human and animal leptospirosis. Bull. World Health Organ. 1968, 39: 925-934.

8. Ahmed A., Thaipadungpanit J., Boonsilp S. et al. Comparison of two multilocus sequence based genotyping schemes for Leptospira species. PLoS Negl. Trop. Dis. 2011, 5: el374.

9. Ahmed A., Grobusch M.P., Klatser P.R., Hartskeerl R.A. Molecular approaches in the detection and characterization of Leptospira. J. Bacteriol. Parasitol. 2012, 3: 1000133.

10. Boonsilp S., Thaipadungpanit J., Amomchai P. et al. A single multilocus sequence typing (MLST) scheme for seven pathogenic Leptospira species. PLoS Negl. Trop. Dis. 2013, 7 (1): el954.

11. Cerqueira G.M., Picardeau M. A century of Leptospira strain typing. Infect. Genet. Evol. 2009, 9: 760-768.

12. Costa F., Hagan J. E., Calcagno J. et al. Global morbidity and mortality of leptospirosis: A systematic review. PLoS Negl. Trop. Dis. 2015, 9: e0003898.

13. Djelouadji Z., Roux V, Raoult D. et al. Rapid MALDI-TOF mass spectrometry identification of Leptospira organisms. Vet. Microbiol. 2012, 6: 142-146.

14. Lau C.L., Smythe L.D., Craig S.B., Weinstein P. Climate change, flooding, urbanisation and leptospirosis: fuelling the fire? Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 2010b, 104:631-638.

15. Leon A., Pronost S., Fortier G. et al. Multilocus sequence analysis fortyping Leptospira interrogans and Leptospira kirschneri. J. Clin. Microbiol. 2010, 48 (2): 581-585.

16. Levett P.N. Leptospirosis. Clin. Microbiol. Rev. 2001, 14: 296-326.

17. Matsuo K., Isogai E., Araki Y. Control of immunologically crossreactive leptospiral infection by administration of lipopolysaccharides from a nonpathogenic strain of Leptospira biflexa. Microbiol. Immunol. 2000, 44: 887-890.

18. Rettinger A., Krupka I., Grunwald K. et al. Leptospira spp. strain identification by MALDI TOF MS is an equivalent tool to 16S rRNA gene sequencing and multi locus sequence typing (MLST). BMC Microbiology 2012, 12: 185.

19. Stoyanova N., Tokarevich N., Gracheva L. et al. Leptospirosis in North-West Russia. EpiNorth. * 2004, 2: 29-32.

20. Voronina O.L., Kunda M.S., Aksenova E.I. et al. The characteristics of ubiquitous and unique Leptospira strains from the collection of Russian centre for leptospirosis. BioMed Res. Int. 2014: 649034.

21. Xiao D., Zhang C., Zhang H. et al. A novel approach for differentiating pathogenic and non-pathogenic Leptospira based on molecular fingerprinting. J. Proteomics. 2015, 119: 1-9.


Рецензия

Просмотров: 237


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0372-9311 (Print)
ISSN 2686-7613 (Online)