Preview

Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии

Расширенный поиск

Фенотипический профиль актуальных полирезистентных сиквенс-типов (ST 1167, ST 944, ST 208) Аcinetobacter baumannii

https://doi.org/10.36233/0372-9311-170

Полный текст:

Аннотация

Введение. Ежегодно в мире регистрируют порядка 1 млн случаев инфекций, вызванных Acinetobacter spp., что составляет 1,8% всех случаев внутрибольничных инфекций. Клинически значимым представителем рода Acinetobacter является Acinetobacter baumannii, о чем свидетельствуют результаты многолетних исследований, проведённых в нашей стране и за рубежом. Внутривидовое типирование микроорганизмов является неотъемлемой частью работы клинического микробиолога при расшифровке вспышек гнойно-септических инфекций в рамках эпидемиологического надзора за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Большинство практикующих микробиологических лабораторий не имеют возможности использовать генотипические методы типирования в силу высоких финансовых затрат.
Цель - разработка диагностической панели для внутривидовой идентификации A. baumannii сиквенс-типов ST 1167, ST 944, ST 208 на основе фенотипических свойств.
Материалы и методы. Изучены внутривидовые признаки 74 штаммов A. baumannii из 4 многопрофильных медицинских организаций крупного промышленного центра с использованием генетических (мультилокусное сиквенс-типирование) и комплекса фенотипических методов (биохимические тесты, биоплёнкообразующая способность, зоны задержки роста вокруг дисков с антибактериальными препаратами, чувствительность к анилиновым красителям, дезинфицирующим средствам и ацинетобактерному бактериофагу). Результаты. Определены фенотипические характеристики 3 ведущих сиквенс-типов A. baumannii (ST 1167, 944, 208). Обсуждение. Сформирован эффективный и экономичный набор дифференцирующих тестов, позволяющих выявить внутривидовые особенности полирезистентных штаммов A. baumannii актуальных сиквенс-типов.
Заключение. Диагностическая панель позволит проводить внутривидовую дифференциацию трёх широко представленных сиквенс-типов A. baumannii в рамках микробиологического мониторинга инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи.

Об авторах

О. С. Федотова
Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора
Россия

Федотова Ольга Семеновна - с.н.с., зав. лаб. клеточных культур

Екатеринбург



Ю. А. Захарова
Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора
Россия

Захарова Юлия Александровна - д.м.н., доц., зам. рук. по научной работе, г.н.с.

Екатеринбург



А. В. Остапчук
Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора
Россия

Остапчук Анна Владимировна - магистр УрФУ им. первого Президента России Б.Н. Ельцина

Екатеринбург



У. А. Бажанова
Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора
Россия

Бажанова Ульяна Александровна - зав. арбитражной лаб.

Екатеринбург



А. А. Захаров
Российский химико-технологический университет имени Д.И. Менделеева
Россия

Захаров Александр Андреевич - магистр

Москва



Список литературы

1. Захарова Ю.А., Фельдблюм И.В. Стандартное эпидемиологическое определение внутрибольничного штамма (эковара) лечебно-профилактического учреждения. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2008; (6): 19–23.

2. Коза Н.М. Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи. Эпидемиология и профилактика (обзорная лекция). Пермский медицинский журнал. 2013; 30(4): 135–43.

3. Онищенко Г.Г. Заболеваемость внутрибольничными инфекциями в Российской Федерации. Гигиена и санитария. 2008; 87(3): 1–6.

4. Покровский В.И., Акимкин В.Г., Брико Н.И., Брусина Е.Б., Захарова Ю.А., Зуева Л.П. и др. Пути совершенствования лабораторной диагностики инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Медицинский альманах. 2012; (2): 12–6.

5. Потехина Н.Н., Рахманов Р.С., Пискарев Ю.Г., Гришин Д.Б., Орлов Е.В. Организация эпидемиологического надзора за антибиотикорезистентностью возбудителей гнойно-септической инфекции в условиях поликлиники. Здоровье населения и среда обитания. 2014; (11): 49–50.

6. Labarca J.A., Salles M.J., Seas C., Guzmán-Blanco M. Carbapenem resistance in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii in the nosocomial setting in Latin America. Crit. Rev. Microbiol. 2016; 42(2): 276–92. https://doi.org/10.3109/1040841x.2014.940494

7. MacVane S.H. Antimicrobial resistance in the intensive care unit: a focus on gram-negative bacterial infections. J. Intensive Care Med. 2017; 32(1): 25–37. https://doi.org/10.1177/0885066615619895

8. Spellberg B., Rex J.H. The value of single-pathogen antibacterial agents. Nat. Rev. Drug. Discov. 2013; 12(12): 963. https://doi.org/10.1038/nrd3957-c1

9. Sievert D.M., Ricks P., Edwards J.R., Schneider A., Patel J., Srinivasan A., et al. Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: summary of data reported to the National Healthcare Safety Network at the Centers for Disease Control and Prevention, 2009-2010. Infect. Control. Hosp. Epidemiol. 2013; 34(1): 1–14. https://doi.org/10.1086/668770

10. Козлова Н.С., Баранцевич Н.Е., Баранцевич Е.П. Антибиотикорезистентность возбудителей гнойно-септических инфекций в многопрофильном стационаре. Проблемы медицинской микологии. 2018; 20(1): 40–8.

11. Скурихина Ю.Е., Туркутюков В.Б. Микробиологические и молекулярно-генетические аспекты антибиотикорезистентности Pseudomonas aeruginosa и Acinetobacter baumannii. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019; 18(6): 34–8. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-6-34-38

12. Тапальский Д.В., Бонда Н.А. Acinetobacter baumannii: распространенность, спектр и динамика антибиотикорезистентности, чувствительность к комбинациям антибиоти- ков. Журнал Гродненского государственного медицинского университета. 2018; 16(3): 286–91. https://doi.org/10.25298/2221-8785-2018-16-3-286-291

13. Potron A., Poirel L., Nordmann P. Emerging broad-spectrum resistance in Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumannii: mechanisms and epidemiology. Int. J. Antimicrob. Agents. 2015; 45(6): 568–85. https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2015.03.001

14. Ulu-Kilic A., Gundogdu A., Cevahir F., Kilic H., Gunes T., Alp E. An outbreak of bloodstream infection due to extensively resistant Acinetobacter baumannii among neonates. Am. J. Infect. Control. 2018; 46(2): 154–8. https://doi.org/10.1016/j.ajic.2017.08.007

15. Dijkshoorn L., Nemec A., Seifert H. An increasing threat in hospitals: multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. Nat. Rev. Microbiol. 2007; 5(12): 939–51. https://doi.org/10.1038/nrmicro1789

16. Горбич Ю.Л., Карпов И.А., Кречикова О.И. Инфекции, вызванные Acinetobacter baumannii: факторы риска, диагностика, лечение, подходы к профилактике. Медицинские новости. 2011; (5): 31–9.

17. Peleg A.Y., Seifert H., Paterson D.L. Acinetobacter baumannii: emergence of a successful pathogen. Clin. Microbiol. Rev. 2008; 21(3): 538–82. https://doi.org/10.1128/cmr.00058-07

18. Тапальский Д.В. Экстремально-антибиотикорезистентные грамотрицательные бактерии: распространение и стратегии антимикробного воздействия. Минск; 2019.

19. Cerceo E., Deitelzweig S.B., Sherman B.M., Amin A.N. Multidrug-resistant gram-negative bacterial infections in the hospital setting: overview, implications for clinical practice, and emerging treatment options. Microb. Drug Resist. 2016; 22(5): 412–31. https://doi.org/10.1089/mdr.2015.0220

20. Lim C.L.L., Chua A.Q., Teo J.Q.M., Cai Y., Lee W., Kwa A.L. Importance of control groups when delineating antibiotic use as a risk factor for carbapenem resistance, extreme-drug resistance, and pan-drug resistance in Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: a systematic review and metaanalysis. Int. J. Infect. Dis. 2018; 76: 48–57. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2018.05.017

21. Фельдблюм И.В., Захарова Ю.А., Николаева А.М., Федотова О.С. Эпидемиологическая диагностика внутрибольничных гнойно-септических инфекций синегнойной этиологии на основе внутривидового типирования возбудителя. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013; (1): 14–20.

22. Воронина О.Л., Рыжова О.Л., Кунда О.Л., Лазарева А.В., Аксенова Е.И., Буркина Н.И. и др. Современные методы лабораторной диагностики в эпидемиологическом мониторинге возбудителей внутрибольничных инфекций. Поликлиника. 2016; (4-1): 22–5.

23. Захарова Ю.А., Федотова О.С., Николаева А.М., Климашина А.В. Изучение чувствительности штаммов Acinetobacter baumannii, циркулирующих в медицинских организациях г. Перми, к антибиотикам и экспериментальной серии бактериофага. Дезинфекционное дело. 2016; (1): 23–8.

24. Jolley K.A., Bray J.E., Maiden M.C.J. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.org website and their applications. Wellcome Open Res. 2018; 3: 124. https://doi.org/10.12688/wellcomeopenres.14826.1

25. Karah N., Sundsfjord A., Towner K., Samuelsen Ø. Insights into the global molecular epidemiology of carbapenem non-susceptible clones of Acinetobacter baumannii. Drug Resist. Updat. 2012; 15(4): 237–47. https://doi.org/10.1016/j.drup.2012.06.001

26. Wang X., Du Z., Huang W., Zhang X., Zhou Y. Outbreak of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii ST208 producing OXA-23-like carbapenemase in a children's hospital in Shanghai, China. Microb. Drug. Resist. 2021; 27(6): 816–22. https://doi.org/10.1089/mdr.2019.0232

27. Fonseca É.L., Caldart R.V., Freitas F.S., Morgado S.M., Rocha L.T., Dos Santos R.C., et al. Emergence of extensively drug-resistant international clone IC-6 Acinetobacter baumannii carrying blaOXA-72 and blaCTX-M-115 in the Brazilian Amazon region. J. Glob. Antimicrob. Resist. 2020; 20: 18–21. https://doi.org/10.1016/j.jgar.2019.06.014

28. Хоулт Дж. Определитель бактерий Берджи. М.: Мир; 1997.

29. МУК 4.2.1890-04. Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. М.; 2004.

30. Giske C.G., Martinez L., Canton R., Stefani S., Skov R., Glupczynski Y., et al. EUCAST guidelines for detection of resistance mechanisms and specific resistances of clinical andor epidemiological importance. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing, EUCAST; 2017.

31. Платонов А.Е., Шипулин Г.А., Платонова О.В. Мультилокусное секвенирование-новый метод генотипирования бактерий и первые результаты его применения. Генетика. 2000; 36(5): 597–605.

32. Bartual S.G., Seifert H., Hippler C., Luzon M.A., Wisplinghoff H., Rodríguez-Valera F. Development of a multilocus sequence typing scheme for characterization of clinical isolates of Acinetobacter baumannii. J. Clin. Microbiol. 2005; 43(9): 4382–90. https://doi.org/10.1128/jcm.43.9.4382-4390.2005

33. Christensen G.D., Simpson W.A., Younger J.J., Baddour L.M., Barrett F.F., Melton D.M., et al. Adherence of coagulase-negative staphylococci to plastic tissue culture plates: a quantitative model for the adherence of Staphylococci to medical devices. J. Clin. Microbiol. 1985; 22(6): 996–1006. https://doi.org/10.1128/jcm.22.6.996-1006.1985

34. O'Toole G., Kaplan H.B., Kolter R. Biofilm formation as microbial development. Annu. Rev. Microbiol. 2000; 54: 49–79. https://doi.org/10.1146/annurev.micro.54.1.49

35. Маслов Ю.Н., Фельдблюм И.В., Пегушина О.Г., Прохорова Л.А., Ахмадзянова А.Р., Алиева Э.Х. Показатель чувствительности бактериальных культур к анилиновым красителям как эпидемиологический маркер. Медицинский алфавит. 2015; 1(6): 23–6.

36. Адамс М. Бактериофаги. Методы изучения вирусов бактерий. Пер. с англ. М.; 1961.

37. Федотова О.С., Захарова Ю.А. Микробиологические аспекты получения препарата бактериофага против Acinetobacter baumannii. Медицинский альманах. 2018; (1): 126–9.

38. Захарова Ю.А., Николаева А.М., Красильникова А.Н., Попова Н.Р., Федотова О.С. Изучение специфической активности и безопасности лечебно-профилактического препарата бактериофага против Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa. Медицинский алфавит. 2016; 1(6): 42–6.


Рецензия

Просмотров: 54


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 0372-9311 (Print)
ISSN 2686-7613 (Online)